Основанный и населенный армянами Нахичевань-на-Дону до начала XX века был духовным центром епархиальной жизни. Это было обусловлено тем, что здесь в 1875 году было основано одно из лучших духовных училищ региона, а в 1881 году по указу императора Александра II оно было преобразовано в семинарию.
Историческое здание семинарии, которое уже 150 лет назад служило армянам, благодаря последовательной работе архиепископа Езраса Нерсисяна было недавно возвращено российскими властями Российской и Ново-Нахичеванской епархии ААЦ. По словам главы епархии, это большое достижение в епархиальной жизни, поскольку здание вновь будет служить образованию и духовному воспитанию армян Ростова-на-Дону.
Как сообщает пресс-служба Епархии, шестилетняя армянская программа обучения в свое время обеспечила семинарии высокий авторитет, и уже в 1915–1916 учебном году в ней обучался 301 ученик и преподавали 15 учителей. Среди ее воспитанников был уроженец Нахичевани-на-Дону Католикос Всех Армян Георг VI. Учебное заведение объединяло вокруг себя выдающихся педагогов, деятелей культуры и благотворителей. Примечательно, что маринист Иван (Ованес) Айвазовский во время одного из визитов в Нахичевань-на-Дону подарил епархиальному училищу одну из своих картин.
20 ноября 1919 года здание было конфисковано, а преподававшее там духовенство по ложным обвинениям было приговорено к смертной казни. Однако, несмотря на непродолжительный период своей деятельности, духовная семинария сыграла огромную роль в образовании и воспитании российских армян, особенно армянской молодежи Дона.